1. Pharmaceutical compounds comprising abasic oligonucleotides

Composés pharmaceutiques comprenant des oligonucléotides abasiques

2. Also provided are conjugates between abasic oligonucleotides and various immunostimulatory nucleic acids, including CpG oligonucleotides, as well as methods of use thereof.

L'invention concerne également des conjugués réalisés entre des oligonucléotides abasiques et divers acides nucléiques immunostimulatoires, notamment des oligonucléotides CpG, et des procédés d'utilisation de ceux-ci.

3. This results in generation of one or more abasic sites which can interact with and/or into where the intercalator molecule can be inserted.

Ceci entraîne la création d'un ou plusieurs site(s) abasique(s) qui peuvent interagir avec la molécule intercalaire et/ou dans l'endroit où celle-ci peut être insérée.

4. The present invention relates to primers for PCR amplification comprising abasic parts within the primer sequences and a method for PCR amplification using the same.

L'invention concerne des amorces pour amplification par PCR qui comprennent des parties abasiques dans les séquences d'amorce, et un procédé d'amplification par PCR utilisant ces amorces.

5. Disclosed are polymeric compounds which are useful as prodrugs, comprising a chain of monomeric nucleosides, nucleoside analogs or abasic nucleosides, wherein at least one of the nucleosides or nucleoside analogs or a heterocyclic derivative thereof is pharmaceutically active and the nucleosides, nucleoside analogs or abasic nucleosides are linked by a phosphodiester group, a phosphorothioate group or an H-, alkyl or alkenyl phosphonate group.

Les composés contiennent une chaine de nucléosides monomères, des analogues de nucléoside ou des nucléosides abasiques, au moins un des nucléosides ou des analogues de nucléoside ou un dérivé hétérocyclique de ces derniers étant pharmaceutiquement actif et les nucléosides, les analogues de nucléoside ou les nucléosides abasiques étant liés par un groupe phosphodiester, un groupe phosphorothioate ou un groupe H-, alkyle ou alcényle phosphonate.

6. The primers for PCR amplification of the present invention contain abasic parts not having specific coding information in their nucleotide sequences, so that they can amplify different templates having mutated sites at the same time.

Les amorces d'amplification par PCR de l'invention contiennent des parties abasiques dépourvues d'informations de codage spécifiques dans leurs séquences nucléotidiques, de sorte qu'elles peuvent amplifier simultanément différentes matrices comportant des sites mutés.

7. A method for characterising nucleic acid molecules comprises the steps of: i) introducing a modified base which is a substrate for a DNA glycosylase into a DNA molecule; ii) excising the modified base by means of said DNA glycosylase so as to generate an abasic site; iii) cleaving the DNA at the abasic site so as to generate an upstream DNA fragment that can be extended; and iv) incubating the extendible upstream fragment in the presence of an enzyme, for example a polymerase or a ligase, allowing for extension thereof and a template nucleic acid and analysing the resultant fragment(s).

L'invention concerne une méthode de caractérisation de molécules d'acide nucléique, qui consiste à: i) introduire une base modifiée constituant un substrat pour une glycosylase d'ADN dans une molécule d'ADN; ii) exciser la base modifiée au moyen de ladite glycosylase d'ADN, de manière qu'un site abasique soit généré; iii) cliver l'ADN au niveau du site abasique, de manière qu'un fragment d'ADN d'amont puisse être étendu; et iv) laisser incuber le fragment d'amont extensible, en présence d'une enzyme, par exemple d'une polymérase ou d'une ligase, de sorte qu'il s'étende, et un acide nucléique matriciel et analyser le(s) fragment(s) résultants.

8. More precisely, the present invention relates to primers capable of amplifying different templates and having abasic parts complementary to mutated site or polymorphic site of template DNA and a method for PCR amplification comprising the steps of mixing the composition for PCR amplification comprising the primers with nucleic acid template; and performing PCR with the mixture.

L'invention concerne plus particulièrement des amorces permettant d'amplifier différentes matrices et qui comportent des parties abasiques complémentaires par rapport à un site muté ou à un site polymorphe d'une matrice d'ADN, et un procédé d'amplification par PCR qui comprend les étapes consistant à: mélanger la composition d'amplification par PCR comprenant les amorces avec une matrice d'acide nucléique; et mettre en œuvre la PCR à l'aide du mélange.

9. A method of detecting a methylated cytosine of the invention comprises the steps of: hybridizing an oligonucleotide capable of hybridizing to a region containing a cytosine which is expected to be methylated in a sample DNA and having an abasic site at a position complementary to the cytosine to the sample DNA; oxidizing a methylated cytosine by reacting an oxidizing agent with the hybridized sample DNA formed in the previous step when a methylated cytosine is present therein; and detecting the oxidized methylated cytosine.

L'invention porte sur un procédé de détection d'une cytosine méthylée de l'invention comprenant les étapes consistant à : hybrider un oligonucléotide capable de s'hybrider à une région contenant une cytosine censée être méthylée dans un ADN échantillon et ayant un site abasique à une position complémentaire de la cytosine par rapport à l'ADN d'échantillon; oxyder une cytosine méthylée par réaction d'un agent oxydant avec l'ADN échantillon hybridé formé dans l'étape précédente lorsqu'une cytosine méthylée est présente dans celui-ci; et détecter la cytosine méthylée oxydée.